Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms