Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Epha5-203ENSMUST00000113399 5166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Stam-201ENSMUST00000028050 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Trpv2-202ENSMUST00000102643 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Pilra-201ENSMUST00000058897 2578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC154862.1-201ENSMUST00000225060 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Cflar-201ENSMUST00000069333 3163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ptger2-201ENSMUST00000046891 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm12508-201ENSMUST00000121282 480 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Plekhs1-202ENSMUST00000178590 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Plekhs1-201ENSMUST00000039666 2378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Hdac7-204ENSMUST00000116409 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Jarid2-210ENSMUST00000173704 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Pitrm1-201ENSMUST00000021611 3318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Fancb-203ENSMUST00000167446 2953 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Mapk6-201ENSMUST00000049355 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ncor1-202ENSMUST00000037575 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Lgals8-206ENSMUST00000135166 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Mospd1-201ENSMUST00000023836 1763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Napb-201ENSMUST00000028926 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 St3gal6-201ENSMUST00000114357 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms