Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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