Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm21026-201ENSMUST00000218628 1345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Rasgrf1-203ENSMUST00000189545 4766 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm43499-201ENSMUST00000202091 2107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Olfr173-202ENSMUST00000206205 2778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm36958-201ENSMUST00000192388 1875 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm28410-201ENSMUST00000188113 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Crb1-ps-201ENSMUST00000160441 895 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm5134-201ENSMUST00000099577 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Zfp94-202ENSMUST00000108436 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Lig3-203ENSMUST00000092849 4560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Ccdc38-201ENSMUST00000092215 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Arsg-201ENSMUST00000020928 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC113059.1-201ENSMUST00000181185 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Pvr-201ENSMUST00000043517 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm31024-201ENSMUST00000207600 2353 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Riok3Q9DBU3 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms