Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm32220-201ENSMUST00000218420 298 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Ppp6c-201ENSMUST00000028087 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Mgat5-202ENSMUST00000171405 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Strn-201ENSMUST00000024881 2967 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Tle3-208ENSMUST00000160882 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 AC113059.1-201ENSMUST00000181185 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Cyp2j9-201ENSMUST00000055693 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm6733-201ENSMUST00000118302 1920 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sox12Q04890 Rnf19a-201ENSMUST00000022890 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Atp7b-202ENSMUST00000110738 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Sema4d-202ENSMUST00000110039 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Mterf2-201ENSMUST00000050813 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ect2l-205ENSMUST00000209178 2586 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Serpinb6a-202ENSMUST00000043552 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 4930509G22Rik-201ENSMUST00000181206 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Pla2g4c-203ENSMUST00000108528 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Rtp1-201ENSMUST00000038730 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Dis3l2-201ENSMUST00000065694 3085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm5644-201ENSMUST00000122039 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sox12Q04890 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms