Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Hoxd9P28357 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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