Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r25W4VSP2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r25W4VSP2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms