Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer3W4VSP1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms