Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms