Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms