Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt27Q9Z320 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms