Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd4Q9Z2D7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms