Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms