Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms