Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn5Q9WU28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pfdn5Q9WU28 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pfdn5Q9WU28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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