Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptpn4Q9WU22 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms