Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms