Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps29Q9QZ88 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps29Q9QZ88 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms