Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip4Q9QXN3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip4Q9QXN3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip4Q9QXN3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip4Q9QXN3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip4Q9QXN3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms