Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg2Q9QXK3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms