Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Limd1Q9QXD8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Limd1Q9QXD8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms