Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thsd1Q9JM61 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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