Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms