Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SacsQ9JLC8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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