Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl6ip1Q9JKW0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6ip1Q9JKW0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms