Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx5Q9JKQ4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx5Q9JKQ4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx5Q9JKQ4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms