Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pole3Q9JKP7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms