Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms