Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra4Q9JJT2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra4Q9JJT2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms