Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad9Q9JIW5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms