Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms