Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmod3Q9JHJ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms