Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf3Q9ET30 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms