Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQP2

Ehd4, EH domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd4Q9EQP2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd4Q9EQP2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ehd4Q9EQP2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd4Q9EQP2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms