Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms