Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms