Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp2Q9EPK2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp2Q9EPK2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms