Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms