Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms