Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms