Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asf1bQ9DAP7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Asf1bQ9DAP7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms