Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms