Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms