Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tbc1d20Q9D9I4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tbc1d20Q9D9I4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Tbc1d20Q9D9I4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbc1d20Q9D9I4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Tbc1d20Q9D9I4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Tbc1d20Q9D9I4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Tbc1d20Q9D9I4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tbc1d20Q9D9I4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tbc1d20Q9D9I4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Tbc1d20Q9D9I4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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