Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y0

Efhd2, EF-hand domain-containing protein D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd2Q9D8Y0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd2Q9D8Y0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd2Q9D8Y0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms