Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms