Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AY761184Q9D848 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AY761184Q9D848 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms