Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms