Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptp4a3Q9D658 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms