Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms